合并財務報表編制有其特殊的程序，主要包括如下幾個方面：

　　(一)統一會計政策和會計期間

　　在編制合并財務報表前，母公司應當統一子公司所采用的會計政策，使子公司采用的會計政策與母公司保持一致。子公司所采用的會計政策與母公司不一致的，應當按照母公司的會計政策對子公司財務報表進行必要的調整;或者要求子公司按照母公司的會計政策另行編報財務報表。同時，母公司應當統一子公司的會計期間，使子公司的會計期間與母公司保持一致。子公司的會計期間與母公司不一致的，應當按照母公司的會計期間對子公司財務報表進行調整;或者要求子公司按照母公司的會計期間另行編報財務報表。

　　(二)編制合并工作底稿

　　合并工作底稿的作用是為合并財務報表的編制提供基礎。在合并工作底稿中，對母公司和子公司的個別財務報表各項目的金額進行匯總和抵銷處理，最終計算得出合并財務報表各項目的合并金額。

　　(三)編制調整分錄和抵銷分錄

　　在合并工作底稿中編制調整分錄和抵銷分錄，將內部交易對合并財務報表有關項目的影響進行抵銷處理。編制抵銷分錄，進行抵銷處理是合并財務報表編制的關鍵和主要內容，其目的在于將個別財務報表各項目的加總金額中重復的因素予以抵銷。

　　在合并工作底稿中編制的調整分錄和抵銷分錄，借記或貸記的均為財務報表項目(即資產負債表項目、利潤表項目、現金流量表項目和所有者權益變動表項目)，而不是具體的會計科目。比如，在涉及調整或抵銷固定資產折舊、固定資產減值準備等均通過資產負債表中的“固定資產”項目，而不是“累計折舊”、“固定資產減值準備”等科目來進行調整和抵銷。

　　(四)計算合并財務報表各項目的合并金額

　　在母公司和子公司個別財務報表各項目加總金額的基礎上，分別計算出合并財務報表中各資產項目、負債項目、所有者權益項目、收入項目和費用項目等的合并金額。其計算方法如下：

　　1.資產類各項目，其合并金額根據該項目加總金額，加上該項目抵銷分錄有關的借方發生額，減去該項目抵銷分錄有關的貸方發生額計算確定。

　　2.負債類各項目和所有者權益類項目，其合并金額根據該項目加總金額，減去該項目抵銷分錄有關的借方發生額，加上該項目抵銷分錄有關的貸方發生額計算確定。

　　3.有關收入類各項目和有關所有者權益變動各項目，其合并金額根據該項目加總金額，減去該項目抵銷分錄的借方發生額，加上該項目抵銷分錄的貸方發生額計算確定。

　　4.有關費用類項目，其合并金額根據該項目加總金額，加上該項目抵銷分錄的借方發生額，減去該項目抵銷分錄的貸方發生額計算確定。

　　(五)填列合并財務報表

　　根據合并工作底稿中計算出的資產、負債、所有者權益、收入、費用類以及現金流量表中各項目的合并金額，填列生成正式的合并財務報表。