由于并購前雙方企業的業務流程和管理模式并不完全相同，ERP系統必然存在諸多差異。并且目前多數ERP軟件整體功能架構不全面，系統又缺乏可擴展性，部分功能模塊沒有預留外部接口使得二次開發難以進行。即使并購前雙方企業使用相同的ERP系統，由于雙方的ERP應用模式不盡相同，信息編碼、業務處理規則、報表模板、信息需求存在差異，甚至由于地區不同存在稅制、會計法規的差異，并購后也一般需要重整業務流程重構ERP應用模式。

    一、根據需求分析構建并購后企業新的管理模式

    每個企業都具有獨特性，采用的管理模式也有差異在組織方式、業務流程、信息流程等方面都存在不同之處。并購企業必須摸清各方的管理特點及其優缺點，做到知已知彼從需求分析出發構造企業整合后的管理模式。

    首先，以企業并購的總體戰略為依據確立并購后企業信息化建設的目標、任務及進度計劃為整合后的企業提供競爭優勢。接著，從合理分配管理資源著手，調整原并購各方的組織架構進行制度設計和優化明確各部門、各單位、各層次的責權利；整合研發、生產、供銷渠道等各方面力量，構建新的內外部供應鏈、產品結構、生產流程等重新確定各類業務處理的程序；分析并購后企業對信息流程的變更需求，弄清整合后企業對信息流程的需求(如內容、格式、加工部門和方式、傳播對象和途徑、數據接口等)。

    此外，還要分析并購企業對系統安全的可靠性、完整性、成本效益、軟硬件平臺等方面的要求。弄清企業并購對管理的全部需求后，可以將其與軟件公司所提供的各種管理模式組件進行充分比較，最終建立并準確描述并購企業未來所需的管理模式作為ERP整合的基礎。

    二、根據管理模式重構并購企業的ERP系統

    無論并購前雙方企業使用何種ERP，并購后都需要根據新的管理模式重構ERP系統。有兩種可供選擇的方案:一是以企業現有ERP為基礎；一是放棄現有的ERP而重新選擇。

    只要原有ERP在功能與技術上仍有一定的先進性則應根據成本效益原則以及出于保留已有信息資源的考慮，在并購后優先選擇繼續使用原有ERP系統。但由于企業并購之后原有的ERP組件不一定能滿足并購后形成的新企業的需求，因而不管雙方企業原有ERP是否相同都需要從整合后的管理模式出發重構ERP系統。

    以原有ERP為基礎的重構步驟一般是：

    1.根據并購后的企業管理模式，進行系統分析研究其所涉及到的任務目標、部門崗位、組織形式、信息及其傳遞路線和時間。在公司戰略層、營運控制層、業務操作層和數據管理層上根據企業管理思想、目標、任務、方法和模型分別確定對ERP組件的需求；

    2.分析并購雙方企業現有的ERP系統，通過比較分析以及考慮軟件性能、技術基礎、供應商背景等因素選擇一個能適應未來需求的ERP系統并進一步弄清企業已擁有的管理組件及其設置情況；

    3.在選中的ERP系統中基于組件進行系統重構，即根據企業未來管理模式所需組件確定ERP的哪些組件需要合并、修改、舍棄、重購或定制構建滿足企業需求的ERP系統；

    4.重構整合后ERP運行平臺，包括硬件平臺和軟件平臺并進行新系統試運行和系統檢測。

    三、根據重構后的ERP進行流程重整和會計協調

    盡管ERP的組件化重構已充分考慮了并購后企業的整體需求，但并購雙方企業仍會遇到不少新問題和新功能。因此重構ERP之后還必須重整并購企業的業務流程、進行會計協調和重構供應鏈。

    1.業務流程重整

    ERP是以業務流程為導向的，并購后的企業必須按它的流程行事，這就需要對現行業務流程進行改造，即根據并購企業信息化的總目標采用改進、優化、再造的策略打破舊的管理結構，從數據到業務環節逐步規范業務流程。業務流程重整涉及每一個部門，內容一般包括人、技術、組織結構以及企業文化的重組。

    并購企業實施業務流程重整的關鍵是思想解放和改革決心。另外業務流程重整還必須成立指導性的權威組織，圍繞業務流程而不是按任務或職能來進行重組，注重提高客戶的滿意度授予員工一定的決策權把控制作為業務流程的一項內容。

    2.會計協調

    并購企業一般存在會計法規、信息需求、會計處理方法上的差異這就需要在重構ERP之后進行會計協調。會計協調的主要內容包括：

    (1)會計處理方法的協調。根據ERP的功能與并購企業的實際情況確定各種核算方法(如材料計價方法、折舊方法、現金流量核算方法)。此外還應利用并購各方在投資機會和現金流量等方面的互補性，選擇適當的會計處理方法降低資本成本、盤活閑置資金。

    (2)會計輸入數據的協調。主要是從種類、格式以及收集方式等方面來規范需要輸入系統的數據(例如需要協調并購后的會計科目、客戶、供應商、存貨、倉庫、固定資產、部門、人員、開戶銀行等代碼體系以及相關信息)。

    (3)會計輸出信息的協調。主要是協調會計制度以及并購企業的需求，規范各種需要打印輸出的賬簿與報表，規范并購后內部管理報表的種類、內容、格式、輸出時間與報送對象。

    3.供應鏈重構

    供應鏈是圍繞核心企業從供應商到最終顧客環環相扣的一條完整業務流程鏈。并購給企業帶來的不僅是規模上的擴張而且是研發、生產、供銷渠道等各方面的重新整合。因此核心企業進行ERP重構之后所產生的影響必將波及整條供應鏈的各個節點，這就需要對供應鏈中的物流、信息流、資金流進行系統化地重新設計和管理以實現整體最優。